人生苦短，我用python（人生苦短我用Python编程）

人生苦短，我用python（人生苦短我用Python编程）

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python的火热是大家有目共睹的，在生物信息领域也不例外，近几年新开发的软件中python的出现频率越来越高，学习和掌握python, 是大势所趋。

在过去的几年中，python2和python3同时共存，在使用过程中，经常出现pyton的不同版本，python模块的不同版本的兼容问题，在还没有conda和docker的年代，解决不同版本的共存问题真的是非常头痛。所以当时只学了点文本处理的皮毛，没有深入研究了。

从2020年开始，正式进入了python3的时代，而且拥有conda和docker技术的加持，版本问题不再是一个拦路虎，正是一个深入了解和掌握python的好时机。内置的标准库赋予了python强大的功能，丰富的第三方模块更是使得python无所不能。对于生信分析而言，个人认为需要掌握以下几个方面

python语法基础, 包括变量类型，数据结构，运算符，程序的控制结构等等数据结构的操作，列表，字典，元组的相关操作正则表达式，文本处理必不可少的技能文件读写，实际使用中最高频的使用场景内置标准库的使用，os, sys等等科学计算相关模块，numpy, scipy等数据可视化，matplotlib, seaborn等生信专用模块的学习，比如biopython, pysam等特定格式的文本内容解析，比如json, xml等网络相关，下载网页并解析内容，urllib, request等办公软件，主要是python读写word, excel, 甚至是pdfconda的使用网站和数据库搭建，django

以上内容，除了最后一点比较考验个人的综合能力，使用频率较低，其他几点都是实际工作中经常会遇到的场景，只有熟练使用这些技能，才能够驾驭python,  使之成为我们手中数据分析的利器。

接下来我会以推文的形式整理我的学习过程， 我相信，若能坚持，必将有效，在新的一年，收获新的技能！

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