【Python小试】判断一条序列GC含量高低

【Python小试】判断一条序列GC含量高低

题目：

随便给定一条序列，如果GC含量超过65%，则认为高。

编程：

from __future__ import division #整数除法def is_gc_rich(dna): length = len(dna) G_count = dna.upper().count('G') C_count = dna.upper().count('C') GC_content = (G_count + C_count) / length if GC_content > 0.65: print('GC content is high') else: print("GC content is normal")

测试

dna="agcTacGAcatgcacgtgcac"is_gc_rich(dna)

解析

Python提供了__future__模块，把下一个新版本的特性导入到当前版本，于是我们就可以在当前版本中测试一些新版本的特性。

主要解决python2版本中和python3不同的一些问题，如print、整数除法、with用法、absolute_import等。上例中即引入了整数除法。

Ref：​​​​​​https://liaoxuefeng.com/wiki/897692888725344/923030465280480​​

作者：Bioinfarmer

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